打开水,缓慢给水箱加水,随水位逐渐升高,当低水位指示灯灭后,此时再等待3-5秒后停止加水,此时水位在低、高水位之间,水位灯均应不亮,设备可投入运行.在未加水至高于低水位时,低水位指示灯亮并有蜂鸣报警声.如进水过多,高水位指示灯亮后,水将从箱体背后溢水口溢出,故当高水位指示灯亮时,把左下侧的放水口橡皮管拉出后拔出放水塞放水（注意：放水橡皮管应向外拉直约300mm左右）.直至高水位指示灯灭后2-3秒,再把放水塞头塞紧.低水位报警时,应及时加水,否则温度控制器停止加热.
将温度设定值调到需要的温度（例如37℃）,加热指示灯（绿）应亮,表示正在加热.（注：环境温度超出25℃,可用空调降低环境温度.）
将二氧化碳控制开关置于“0".（关闭电磁阀,因为在未通二氧化碳培养时电磁阀长时间通电会发热,影响电磁阀寿命.）
待温度达到设定值后.将二氧化碳钢瓶开启,（开启前,减压阀应尽量拧松,防止减压阀输出压力过高导致输气橡皮管暴裂!）减压阀上进气压力表指示钢瓶内二氧化碳压力,缓慢地顺时针拧减压阀旋扭.使减压阀输出压力指示为0.05Mpa,指针处于刻度线中间.此时用拨盘设定二氧化碳浓度（出厂时调整为5%）,开启二氧化碳控制开关前要关闭空气流量计和二氧化碳流量计,二氧化碳控制器显示“1",此时即有二氧化碳进入内室.随着浓度升高,二氧化碳控制器显示出二氧化碳浓度值,到设定值时,设备自动切换到空气及二氧化碳补气状态.此时需调整空气流量计浮子应指示在760 ml/min（出厂时已调好）,二氧化碳流量计浮子应指示在40 ml/min（出厂时已调好）；若浮子偏离上述数值时,可调节流量计旋钮到760 ml/min（空气）及40 ml/min（二氧化碳）准确为止.（在开、关箱门后,短时间内空气流量计无流量,CO2 流量计流量也小于40ml/min这是正常现象）