实验室废水处理的原理是将高浓度的废酸碱液经中和后排放至中性。高浓度有机溶剂中含有少量被测物质和其他试剂应回收利用。用于回收的高浓度废水应集中存放回收，低浓度废水处理后排放，根据废水性质确定贮存容器和贮存条件。不同的废水一般不允许混合，避免光照，远离热源，以避免不良的化学反应。废水储存容器必须贴上标签，注明类型、储存时间等。
实验室废水管理：
要高度重视实验室废水管理，在实施绿色实验室中发挥示范作用。
(1)完善管理制度和规范。
它在实际工作中起到了示范作用，对废水的处理也很重视。建立实验室废水处理管理制度，根据实际情况制定便于操作的技术规范，并专人负责，将废水处理纳入日常管理。
(2)废水的集中管理和处理。
实验室废水种类繁多，但数量不多。如果每个实验室分别处理每个实验产生的废水，可能会在设备、人力、时间等方面造成困难。因此，根据废水的种类，每个实验室都可以通过分类、集中储存和专人定期统一处理的方式进行收集。为了减少和避免“二次废水”，注意废物的回收利用。
(3)反复使用试剂。
试剂回收是一项双赢的措施，可以减少环境污染，节约监测部门的成本。应采取有效措施回收不直接参与化学反应的有机溶剂。
实验室废水处理应注意的事项：
1)尽量回收溶剂，反复使用，不妨碍实验；
2)为了便于处理，收集分类通常分为：a)易燃物质b)阻燃物质c)含水废水d)固体物质等。
3)水溶性物质容易丢失在水溶液中。因此，应注意实验室废水的处理和回收。然而，甲醇、乙醇和乙酸等溶剂容易被细菌分解。因此，这种溶剂的稀溶液可以用大量水稀释后排出。
4)含重金属废水经分解后，作为无机废水处理。
