多重 PCR 通过在同一个反应中同时完成多个基因的扩增成为临床与基础研究领域中一种简便快捷的筛选检测方法。已有大量文献详细的讨论了通常影响 PCR 反应质量的条件,而在多重 PCR 中常见的困难和重要的实验因素却鲜见报道。本文使用多对引物对多重 PCR 的各种条件进行了研究。研究表明,对于成功进行多重 PCR 尤为重要的因素是:用于扩增不同基因的不同引物对之间的相对浓度、 PCR 缓冲液的浓度、循环温度、氯化镁和 dNTP 浓度间的平衡。在实验的基础上,本文给出了一个多重 PCR 的标准方法,并给出常见问题的解决办法。
介绍:
多重 PCR 就是在同一个反应管中同时完成多个不同基因扩增的 PCR 反应。这一方法zui早报道于 1988 年 ( 6 ) ,已被成功的用于缺失分析 ( 2,8 ) ,突变 ( 14 ) 与多态性 ( 11 ) ,以及定量分析 ( 10 ) 与反转录 PCR ( 7 ) 等多个 DNA 检测领域。
PCR 反应中各种试剂的作用已被讨论过 ( 3,9,12,13 ) ,也已有许多研究团体对多重 PCR 的方法进行了描述。但是很少有人对影响多重 PCR 结果的因素(如引物浓度、循环条件等)进行过深入的讨论 ( 5,15 ) 。本实验使用常规含 KCl 的 PCR 缓冲液对 50 种基因的各种组合进行了多重 PCR 反应,针对伴随多重 PCR 的一些问题,如均一性差、某些基因难以扩出、重复性差等问题,对影响扩增的相关参数进行了研究。基于实验经验我们设计了多重 PCR 的标准方法 (Figure 1) ,并提供了对可能碰到的许多问题的解决方案,这对于临床与基础研究领域中使用 PCR 技术的工作者都会有所帮助。
材料与方法:
PCR使用的标准溶液和试剂
100 mM 母液的核苷酸 (dNTP) ( 购于 Pharmacia Biotech dCTP (Amersham, Arlington Heights, IL,USA) 。使用 100μL 、 25μL 、 6.2μL 反应体积得到的结果相同,对于小的反应体积,加样(尤其是 dNTP )至关重要。实验中使用了各种 PCR 仪,经过细微调节后都得到了好的实验结果。